Свободная система молекулярной визуализации.

PyMOL может производить высококачественные 3D-изображения мелких молекул и биологических макромолекул, таких как белки. По словам автора статьи, почти четверть всех опубликованных изображений 3D-белковых структур в научной литературе были сделаны используя PyMOL.

PyMOL является одним из немногих инструментов молекулярной визуализации открытым исходным кодом, доступных для использования в структурной биологии. Py часть имени программы указывает на то что это расширение, которое дополняет язык программирования Python. PyMOL использует библиотеку OpenGL Extension Wrangler (GLEW) и Freeglut и может решать уравнения Пуассона-Больцмана с помощью адаптивного решателя Пуассона Больцмана. Для OS X доступны родные aqua бинарники.

Платные бинарники. 1 августа 2006, DeLano Scientific установил контролируемый доступ к предварительным сборкам PyMOL (в том числе бета-версиям) распространяемым компанией. Доступ к этим исполняемым файлам в настоящее время ограничен платежеспособных клиентов, но является бесплатным для студентов и преподавателей. Тем не менее, текущий исходный код по-прежнему доступен бесплатно как и старые сборки. Для получения бинарников вы можете скомпилировать исполняемый файл из исходного кода или оплатить подписку на вспомогательные услуги.

Примеры молекулярного редактирования PyMOL, даэдрическое вращение связей, интерактивная молекулярная релаксация с "Sculpting mode", полезные функции для подготовки ввода геометрии для квантового химического программного обеспечения.


Перевод с Википедии: https://en.wikipedia.org/wiki/PyMOL

Сайт проекта

Скачать PyMOL !