Обновлено: 23.02.2016 - 13:36

Система молекулярной визуализации с 3D графикой на основе OpenGL.

Свободная система визуализации молекул, созданная Уоррен Лифорд Делано и коммерческой компанией DeLano Scientific LLC, которая занимается созданием полезных научных программ для образовательных целей. В настоящее время, PyMOL имеет коммерческую поддержку от Schrödinger, Inc PyMOL может производить высококачественные 3D изображения небольших молекул и биологических макромолекул , таких как белки. Согласно автору, было сделано почти четверть всех опубликованных в научной литературе трёхмерных структур белков.

PyMOL является одним из немногих Open Source инструментов визуализации для структурной биологии. Py часть имени программы говорит о том что используется язык программирования Python.
PyMOL использует OpenGL Extension Wrangler Library (GLEW) и Freeglut, и может решать уравнения Пуассона-Больцмана. PyMOL использует Tk для GUI виджетов, родные Aqua бинарники для OS X можно найти у Schrödinger.

Несвободные бинарники

Первого августа 2006 года DeLano Scientific принимает систему контроля загрузок для предварительно скомпилированных бинарных сборок. Доступ к этим бинарным сборкам в настоящее время ограничен для платёжеспособных клиентов, но свободен для студентов и преподавателей. Тем не менее, исходный код продолжает быть доступным бесплатно, а взрослые могут заняться компиляцией. В то время как для других операционных систем системы сборок открыты и бесплатны, для Windows нет (но бинарники PyMOLпод Windows можно скачать бесплатно)

Не студенты и не преподаватели могут скомпилировать PyMOL самостоятельно или подписаться на коммерческую поддержку PyMOL чтобы получить готовые бинарные сборки.

Пример некоторых молекулярных функций редактирования PyMOL. Диэдральное вращение связей и интерактивные молекулярные релаксации в режиме скульптуры, эти функции полезны для подготовки геометрии для приложений по квантовой химии.



Такая же структура белка ( ТРВ протеазы - PDB : 1LVB ) оказывается в различных режимах. Стандартная карикатура, сквозная поверхность, выделенный баррелей, ' QuteMol '-like, 'Goodsell'-like, глянцевая поверхность и b-factor putty.

https://en.wikipedia.org/wiki/PyMOL
------------------------
ТРИО теплый пол отзыв
Vkjust отзыв
Заработок на сокращении ссылок
Earnings on reducing links
Код PHP на HTML сайты

---

Я уже пять лет не занимаюсь сайтом, так как работаю по 12 часов. Образование у меня среднее, и по этому нет нормальной работы. Если бы сайт приносил по 100$ в месяц, я бы добавлял по 50 статей каждый месяц. Если отправите пожертвования, я оставлю Ваши имена и фамилии в списке благодетелей !
Bitcoin: 1AP3JCZVFpHzZwcAyNztbrbFFiLdnKbY1j
Litecoin LfHXHz4k6LnDNNvCodd5pj9aW4Qk67KoUD
Dogecoin D9HHvKNFZxRhjtoh6uZYjMjgcZewwiUME9
Есть также другие кошельки.

Категория: Биоинформатика, 3D-рендеринг

Лицензия:
Python License (CNRI Python License)


Интерфейс  графический
Язык программирования:
Python, C, Tcl
Сайт проекта
Скачать PyMOL